| 科室 | 复旦专科榜排名(年份) | 国家重点学科(年份) | 国家临床重点专科(年份) | 省重点专科(年份) | 市重点专科(年份) | 院优势专科 | 挂靠中心/实验室资质 |
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| 骨科 | 复旦专科榜未进入全国前十(华南区骨科靠前,具体名次官方未统一披露) | 否(国家重点培育学科:骨科) | 国家临床重点专科(骨科) | 广东省高水平临床重点专科(骨科) | 官方未统一披露 | 是 | 广东省骨科研究院、广东省骨科质量控制中心挂靠单位 |
| 脊柱外科 | 复旦未单列(隶属骨科体系) | 否(依托骨科国家重点培育学科) | 依托骨科国家临床重点专科 | 广东省重点临床专科(骨科体系) | 官方未统一披露 | 是 | 脊柱微创与功能重建方向 |
| 运动医学科 | 复旦未单列 | 否 | 否 | 广东省临床重点专科(运动医学科) | 官方未统一披露 | 是 | 关节镜与运动损伤微创方向 |
| 肾内科 | 复旦未单列 | 否 | 否 | 广东省重点临床专科(肾内科) | 官方未统一披露 | 是 | 血液净化与慢性肾病管理 |
| 内分泌代谢科 | 复旦未单列 | 否 | 否 | 广东省高水平临床重点专科(内分泌代谢科) | 官方未统一披露 | 是 | 国家标准化代谢性疾病管理中心(MMC)所在单位 |
| 泌尿外科 | 复旦未单列 | 否 | 否 | 广东省重点临床专科(泌尿外科) | 官方未统一披露 | 是 | 微创泌尿与结石方向 |
| 妇科 | 复旦未单列 | 否 | 否 | 广东省重点临床专科(妇科) | 官方未统一披露 | 是 | 妇科肿瘤与腔镜微创 |
| 创伤骨科 / 手外科 | 复旦未单列(属骨科体系) | 否(依托骨科国家重点培育学科) | 依托骨科国家临床重点专科 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 创伤救治中心 |
| 重症医学科 | 复旦未单列 | 否 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 急危重症救治 |
| 心血管内科 | 复旦未单列 | 否 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 心脏康复中心(国内首批建设单位) |
口径说明:①「国家临床重点专科」与「国家临床重点专科建设项目」口径不同,本院已建成国家临床重点专科为骨科。②「国家重点学科」指二级学科国家重点学科,本院为骨科国家重点培育学科(非一级学科国家重点学科)。③省/市重点专科具体批次年份官方未统一披露,均标注「官方未统一披露」,不作编造。④复旦排名为专科声誉榜,本院综合榜及多数专科未进入全国前十,具体名次以复旦版当年发布为准。
